原告违反竞业协议的仲裁时效为一年。这一时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。具体来说，如果公司发现员工违反了竞业限制协议，并要求赔偿，那么公司需要举证证明自己是什么时候知道员工违约的，从知道的那一刻开始算起，一年内可以提起仲裁。

以下是对这一结论的详细解释：

1. 法律依据：

   • 根据《劳动争议调解仲裁法》（2008年5月1日起施行）第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。这一条款直接规定了仲裁时效的长度。

2. 时效期间的计算：

   • 仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果公司发现员工违反了竞业限制协议，那么从公司知道或应当知道这一违约行为的那一刻起，一年内可以提起仲裁。

3. 时效中断的情况：

   • 如果在时效期间内，当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务，那么仲裁时效会中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。这意味着，如果公司在时效期间内向员工提出了赔偿要求，或者向有关部门寻求了帮助，那么仲裁时效会重新计算。

综上所述，原告（通常是公司）在发现员工违反竞业限制协议后，有一年的仲裁时效来提起仲裁要求赔偿。如果在这一时效期间内没有提起仲裁，那么公司将失去通过仲裁方式追究员工违约责任的权利。因此，公司应当密切关注员工的竞业行为，一旦发现违约行为，应当及时采取措施保护自己的合法权益。