三方协议和实习协议在不同的单位里是可以同时进行的，法律上并没有明确禁止这一行为。下面我来详细解释一下：

三方协议

三方协议通常是指毕业生、用人单位和学校三方之间签订的一种协议，主要目的是明确各方在毕业生就业过程中的权利和义务。这份协议在毕业生正式到用人单位报到、用人单位正式接收毕业生后自行终止，然后用人单位会与毕业生签订正式的劳动合同。

实习协议

实习协议则是实习生与实习单位之间签订的一种协议，用于明确实习期间双方的权利和义务，包括实习时间、实习岗位、实习待遇、实习纪律等。

同时进行的情况

从法律角度来看，并没有明确规定不能同时签订三方协议和实习协议，尤其是在不同的单位里。这种情况下，你需要关注的是两个协议的具体内容，确保它们之间不存在冲突或矛盾。比如，你要确保实习协议中的时间安排不会与三方协议中的报到时间或工作时间产生冲突，同时也要确保两个协议中的其他条款不会相互抵触。

注意事项

1. 明确协议内容：在签订任何协议之前，都要仔细阅读协议内容，确保自己完全理解并同意其中的条款。
2. 遵守协议规定：一旦签订了协议，就要严格遵守其中的规定，避免产生不必要的纠纷。
3. 沟通协调：如果同时签订了三方协议和实习协议，并且它们之间存在某种程度的关联或影响，务必及时与两个单位进行沟通协调，确保各方都能理解并接受你的安排。

综上所述，三方协议和实习协议在不同的单位里是可以同时进行的，但你需要确保两个协议之间不存在冲突或矛盾，并且严格遵守协议规定。如果有任何疑问或问题，可以随时向我咨询。