在签署协议时按手印，关于使用哪个手指并没有严格的法律规定。通常在社会习惯中，人们倾向于使用右手食指进行指纹按压，这主要是因为右手食指在日常生活中的使用频率较高，且相对不易发生缺损，从而成为了一种约定俗成的做法。然而，在特殊情况下，如刑事案件中，可能会需要采用右手拇指的指纹作为证据。

从法律角度来看，《民法典》第四百九十条明确规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这里并没有指定必须使用哪个手指的指纹，因此理论上讲，使用任意一个手指，甚至是左手的手指进行指纹按压都是可以的。

在实际操作中，为了确保指纹的清晰度和可辨识性，以及防止签名内容被恶意篡改或伪造，建议按下指纹时确保指纹与签名部分紧密结合，并尽可能选择使用清晰、完整的手指指纹。如果遇到特殊情况，还可以在相关文件中详细注明所按压的具体手指部位。

总的来说，虽然社会习惯中倾向于使用右手食指，但法律上并没有明确规定必须使用哪个手指。在选择时，应考虑到指纹的清晰度和可辨识度，以及个人习惯和特殊情况的需求。