综合执法大队要求提供营业执照复印件是合法的，但需符合法定程序和权限。
在行政执法过程中，综合执法大队作为政府执法部门，有权对市场主体的经营行为进行监督检查。为了核实市场主体的经营资质和相关信息，综合执法大队可以要求市场主体提供营业执照复印件等相关资料。这是行政执法中的一种常见手段，旨在确保市场主体的合法经营和市场的公平竞争。
然而，需要注意的是，综合执法大队在要求提供营业执照复印件时，必须遵守法定程序和权限。具体来说：
出示执法证件：执法人员在执行公务时，应当主动出示执法证件，表明身份和执法权限。
说明理由和依据：在要求提供营业执照复印件时，执法人员应当说明理由和依据，告知市场主体这是行政执法过程中的一项正常要求。
保护商业秘密和个人隐私：在获取营业执照复印件等敏感信息时，执法人员应当注意保护市场主体的商业秘密和个人隐私，不得泄露或滥用这些信息。
遵守相关法律法规：执法人员在执法过程中必须严格遵守相关法律法规，不得超越职权或滥用职权。
综上所述，综合执法大队要求提供营业执照复印件是合法的，但必须在法定程序和权限范围内进行。如果市场主体对执法行为有异议或认为执法行为存在违法情形，可以依法向相关部门投诉或申请行政复议、提起行政诉讼等法律救济途径。