关于实习三方协议中的违约金数额，这并非是一个固定或统一的标准，而是由毕业生、用人单位以及学校三方，在签订协议时根据具体情况共同协商确定的。以下是对此问题的详细解答：

一、法律基础与原则

1. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定违约金及其计算方法，但这一约定应当与实际损失相符。如果违约金低于实际造成的损失，法院或仲裁机构有权增加；反之，如果违约金过高，也可适当减少。

2. 公平原则：在设定违约金时，必须遵循公平原则，确保违约金的数额不会显失公平。过高的违约金可能面临法律调整，而过低的违约金则可能无法有效补偿守约方的损失。

二、实际操作中的约定

1. 常见范围：在实际操作中，三方协议中的违约金数额通常落在几千元至万元之间，例如3000元、5000元或8000元等，其中5000元左右的数额较为常见。

2. 与职位和成本相关：违约金的数额往往与毕业生的职位重要性以及用人单位的投入成本密切相关。对于关键职位或高成本投入的情况，违约金可能会相应提高，但通常不会过分偏高。

3. 协商确定：最终违约金的数额应由三方通过充分协商来确定，考虑因素包括违约行为的性质、可能造成的损失以及各方的谈判地位等。

三、具体案例与参考

实际案例中的违约金数额各不相同，有的约定为固定数额（如5000元），有的则按损失比例计算（如20%）。在司法实践中，如果协议中的违约金数额显失公平或与实际损失不符，法院会根据具体情况进行调整。

四、建议与注意事项

1. 充分协商：在签订三方协议时，建议三方充分沟通并明确约定违约金的数额或计算方法，以确保协议的公平性和合法性。

2. 合理设定：违约金的数额应合理设定，既要能够弥补守约方的损失，又要避免过高而引发法律纠纷。

3. 增强法律意识：毕业生在签订协议时应仔细阅读关于违约金的条款，对于不合理或过高的违约金应及时与用人单位协商调整。

4. 法律救济：如果出现违约情况且认为约定的违约金数额不合理，一方有权向法院申请调整，以维护自身合法权益。

综上所述，实习三方协议中的违约金数额并无固定标准，而是需要根据具体情况进行协商确定。在签订协议时，三方应充分考虑各种因素，确保违约金的合理性，以避免未来可能出现的法律纠纷。