在综合工时制下，年休假不应算作工时。以下是详细的解释：
年休假的性质：
- 年休假是《职工带薪年休假条例》赋予劳动者的合法权益，其本质是为了让劳动者在连续工作一定时间后能够有时间休息和放松，以恢复体力和精力。因此，年休假是劳动者的一种福利，而非继续提供劳动的时间。
综合工时制的特点：
- 综合工时制是一种特殊的工时制度，它以一定周期（如周、月、季、年）为单位综合计算工作时间。在这种制度下，虽然工作时间的安排更加灵活，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
不计入工时的依据：
- 从工时计算的角度来看，综合工时制下的工时计算主要依据劳动者实际从事工作的时间。由于年休假期间劳动者并未实际提供劳动，因此不应将年休假时间计算在工时内。
- 此外，将年休假算作工时也会违背设立年休假制度的初衷，即保障劳动者的休息权利。如果年休假算工时，可能会导致劳动者无法真正享受到应有的休息时间。
实际操作中的考量：
- 虽然年休假不算工时，但劳动者在年休假期间是享有带薪待遇的。用人单位应按照劳动者正常工作期间的工资收入支付年休假工资报酬，确保劳动者在享受年休假的同时不会因未实际工作而遭受经济损失。
- 用人单位在统计和管理综合工时制下的工时情况时，应明确区分正常工作时间、加班时间和年休假时间等不同的时间类别，建立健全的考勤制度和工时记录制度，以确保工时计算的准确性和合规性。
综上所述，综合工时制下的年休假不应算作工时，这一结论既符合法律法规的规定，也体现了对劳动者休息权利的尊重和保护。如果你在实际操作中遇到相关问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。