在诉讼中，如果被告已经履行了原告的诉讼请求，但原告仍然不撤诉，这种情况下的处理方式主要取决于诉讼的具体类型和实际情况。以下是从不同角度给出的分析：

1. 民事诉讼中的处理：

   • 在民事诉讼中，如果被告已经履行了还款或其他义务，而原告仍不撤诉，法院会对案件进行审查。若经审查确认被告已经履行了义务，且案件没有继续审理的必要，法院可能会裁定准许原告撤诉。
   • 然而，如果案件中存在其他争议或需要进一步处理的事项，法院也可能会决定继续审理。在这种情况下，原告的不撤诉权并非绝对，而是需要根据具体案情和法律规定来确定。
   • 如果原告坚持不撤诉且无合理理由，法院经审理查明被告已经履行义务，可能会依法判决驳回原告的诉讼请求。

2. 行政诉讼中的处理：

   • 在行政诉讼中，如果被告行政机关在诉讼过程中履行了原告所诉的法定职责，而原告仍不撤诉，法院的处理方式可能略有不同。
   • 根据行政诉讼法的相关规定，即使被告在诉讼中改变了原行政行为，原告不同意撤诉的，法院仍应继续审理，并对原行政行为是否合法进行审查。
   • 如果法院审查认为原行政行为违法，即使被告已经履行了法定职责，法院也可能判决确认原行政行为违法。

综上所述，诉讼中被告已经履行原告仍不撤诉的处理方式取决于诉讼的具体类型和实际情况。在民事诉讼中，法院会根据案件是否还有继续审理的必要来决定是否准许撤诉；在行政诉讼中，法院则会对原行政行为的合法性进行审查，并根据审查结果作出相应判决。无论哪种情况，原告的不撤诉权都并非绝对，而是需要根据具体案情和法律规定来确定。如果你有更具体的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。