复印件上亲自签名的协议，在特定条件下是有效的。具体来说：
复印件签名的有效性：复印的合同上签名是有效的，但前提是原件必须核对无误。如果复印件与原件完全相符，那么该复印件将具备一定的法律效力，尽管其效力可能低于原件。这是因为，在法律上，原件通常被视为最具权威性的证据。
双方明确约定：除非合同双方对复印件进行了重签，并明确注明“经共同协商，本复印件在双方签署后，享有与原件同等效力”，否则，复印件的法律效力可能受到质疑。这样的明确约定有助于消除因复印件而产生的任何潜在争议。
法律行为的有效性要件：根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，一个民事法律行为要有效，必须满足三个条件：行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定，且不违背公序良俗。因此，即使在复印件上签名，只要满足这些条件，该签名行为仍然是有效的。
综上所述，复印件上亲自签名的协议在特定条件下是有效的，但为了确保其法律效力，最好尽可能使用原件进行签名，或者在复印件上签名时明确注明其与原件具有同等效力。如果你有任何关于合同纠纷或其他法律问题的疑问，欢迎随时向我咨询。