拖欠工程款的企业不能发放施工许可证的依据主要在于相关法律法规对施工许可的颁发条件有明确规定，其中通常要求建设单位应当具备相应的资金或者资金来源已经落实，以确保工程能够顺利进行。如果企业拖欠工程款，表明其资金状况可能存在问题，无法满足这一条件，因此不能发放施工许可证。
具体来说：
法律法规依据：根据《中华人民共和国建筑法》以及相关法律法规，申请领取施工许可证应当具备的条件中，通常包括“已经办理工程质量监督和施工安全监督手续，并已确定施工进度、竣工交付使用时间和工程造价等”，这些条件的背后都隐含着对建设单位资金状况的考量。如果建设单位拖欠工程款，很可能意味着其资金状况不佳，无法保障工程的顺利进行，因此不符合施工许可的颁发条件。
资金落实要求：施工许可证的颁发，旨在确保工程能够按照既定的计划、质量和安全标准进行。如果建设单位资金不落实，不仅可能导致工程延期、停工，甚至可能引发工程质量问题和安全事故。因此，拖欠工程款的企业，在资金状况未得到明显改善之前，通常无法获得施工许可证。
综上所述，拖欠工程款的企业不能发放施工许可证，主要是基于法律法规对施工许可颁发条件的明确规定，以及对企业资金状况的考量。如果企业存在拖欠工程款的问题，应当积极采取措施解决资金问题，以确保工程的顺利进行，并符合相关法律法规的要求。如有进一步的法律问题，可直接向我咨询。