建筑工程挂靠协议是违法的，因此无效。具体分析如下：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。建筑工程挂靠行为违反了《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国招标投标法》以及《建设工程质量管理条例》等法律法规的强制性规定，因此挂靠协议无效。
挂靠行为的定义与危害：
- 建筑工程挂靠行为指的是不具备相应资质条件的单位或个人，以被挂靠单位的名义对外承接工程并向其缴纳一定管理费的行为。这种行为严重扰乱了建筑市场的正常秩序，因为挂靠人往往缺乏必要的技术、人员、设备等条件，可能导致工程质量难以保证，进而损害建设单位、其他利害关系人和社会公众的利益。
法律责任：
- 允许他人以自己名义承揽工程，或者借用他人名义或资质证书承揽工程的，将面临严厉的法律责任，包括责令改正、没收违法所得、罚款、停业整顿、降低资质等级、吊销资质证书等行政处罚。在情节严重的情况下，甚至可能受到刑事处罚。
实际施工人的权益保护：
- 尽管挂靠协议无效，但在工程竣工验收合格且符合相关质量标准的前提下，实际施工人（挂靠人）仍有权参照合同约定向被挂靠人主张支付工程价款。这是为了保护实际施工人的合法权益，避免因挂靠协议的无效而使其劳动成果得不到应有的回报。然而，这并不意味着挂靠行为被鼓励或认可，而是出于对实际施工人劳动成果的合理保护。
特殊情况的考量：
- 在处理无资质的企业或个人挂靠有资质的建筑企业承揽工程时，应区分内部关系和外部关系。挂靠人与被挂靠人之间的协议因违反法律的禁止性规定而无效。而挂靠人以被挂靠人名义对外签订合同的效力，则应根据合同相对人是否善意、在签订协议时是否知道挂靠事实来作出认定。
综上所述，建筑工程挂靠协议是无效的，且挂靠行为本身严重扰乱建筑市场秩序，危害公共安全。因此，强烈建议建筑企业和个人不要签订或参与任何形式的挂靠协议，而应通过合法途径获取相应的资质和许可，严格遵守相关法律法规和行业规范。