当房屋实际权利人与不动产登记簿登记内容不相符时，这是一个涉及法律权益和产权归属的重要问题，需要谨慎处理。以下是根据相关法律规定和实际操作经验，为您提供的详细处理建议：
一、明确问题产生的原因
首先，需要明确导致这种不一致情况产生的原因，可能包括历史遗留问题（如房屋继承、赠与等未办理过户手续）、交易过程中的疏忽（如未及时办理产权变更登记）、登记机构的失误（如审核材料或录入信息错误）以及恶意行为（如欺诈、胁迫或伪造签名进行虚假登记）等。
二、收集证据，确认权利归属
收集证据：为了证明自己的实际权利，您需要收集相关证据，如购房合同、付款凭证、居住证明、相关协议等。这些证据应能够清晰、有力地证明您对房屋的实际所有权或使用权。
法律咨询：建议寻求专业律师的帮助，对收集到的证据进行评估和分析，确定您的法律地位和维权途径。律师的专业意见将为您提供有力的法律支持。
三、尝试协商解决
在明确双方权利义务的基础上，您可以尝试与对方（即登记簿上的权利人）进行协商，寻求和解。协商内容可以包括更正登记、赔偿损失等。如果双方能够达成一致意见，这将是最快捷、最经济的解决方式。
四、申请更正登记
如果协商无果，您可以根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向不动产登记机构申请更正登记。具体步骤如下：
提交申请书：向不动产登记机构提交更正登记的书面申请。
提供身份证明和证明材料：随申请一同提交您的身份证明以及证明登记确有错误的材料，如上述收集的证据等。
等待审核和处理：不动产登记机构将对您的申请进行审核，如果认为申请有理有据，将依法进行更正登记。
五、提起诉讼
如果申请更正登记遭到拒绝或对方拒绝配合更正登记，您可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要充分举证证明自己的实际权利和对方的过错行为，请求法院确认您的实际权利，并判决对方协助办理更正登记手续。
六、注意诉讼时效和程序要求
在处理此类问题时，还需要注意诉讼时效和程序要求。更正登记的申请应在知道或应当知道登记错误之日起的合理期限内提出。提起诉讼时，也需遵守民事诉讼法关于管辖、起诉条件、审理程序的规定。
综上所述，当房屋实际权利人与不动产登记簿登记内容不相符时，您应根据具体情况选择合适的处理方式，并咨询专业律师的意见以确保您的合法权益得到妥善维护。同时，不动产登记机构也应加强审核和管理，减少登记错误的发生，提高登记的准确性和公信力。