员工违规在外单位挂靠一级建造师是违法的，但这与员工申请劳动仲裁的合法性无直接关联。下面我将详细解释这两个方面：

1. 关于违规挂靠一级建造师：

   • 根据相关法律法规，一级建造师必须注册在具有相应资质的单位，并严格按照注册单位的要求从事执业活动。
   • 如果员工违规在外单位挂靠一级建造师，即未实际在该单位工作却将其建造师资质挂靠在该单位，以获取不正当利益，这种行为是违法的。
   • 违规挂靠可能导致建造师资质被撤销、罚款甚至承担刑事责任等严重后果。

2. 关于申请劳动仲裁的合法性：

   • 劳动仲裁是员工与用人单位之间解决劳动争议的一种法定方式。
   • 员工申请劳动仲裁，通常是因为与用人单位在劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险、福利等方面存在争议。
   • 申请劳动仲裁是员工的合法权益，即使员工存在其他违法行为（如违规挂靠），也不影响其申请劳动仲裁的合法性。
   • 劳动仲裁机构会根据双方提供的证据和法律规定，公正地裁决劳动争议。

综上所述，员工违规在外单位挂靠一级建造师是违法的，但这并不妨碍其依法申请劳动仲裁来解决与用人单位之间的劳动争议。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要详细的法律建议，可以直接向我咨询。