如果您的三轮摩托车的合格证遗失了，上牌的过程可能会有些复杂，但并非无法解决。以下是一些可能的解决方案：

首先，您需要准备一些必要的文件，包括您的身份证明（如身份证）、购车发票（如果还在的话），以及一份书面说明，解释合格证的丢失情况。书面说明中应包括您的身份信息、车辆来源以及您承诺车辆是符合登记要求的。

接下来，您需要前往当地的车管所或者交警部门进行咨询，了解具体的上牌流程和所需材料。由于不同的地方可能有不同的规定，所以最好先确认清楚。

在办理上牌的过程中，您可能需要填写一些表格，并提交上述准备的文件。车管所或交警部门会对您的车辆进行检查，确认其符合相关标准和规定。

如果您的三轮摩托车是近期购买的，并且符合当地的排放标准和其他相关法规，那么即使没有合格证，也有可能顺利上牌。但是，如果车辆较旧或者不符合现行标准，那么上牌可能会更加困难。

另外，如果您能找到销售商或者制造商重新开具一份合格证，那么上牌的过程将会更加顺利。您可以尝试联系他们，看是否有可能补办合格证。

总的来说，虽然合格证的丢失会给上牌带来一些困难，但只要您的车辆符合要求，并且您能够提供足够的证明文件，还是有可能顺利上牌的。建议您尽早前往车管所或交警部门咨询并办理相关手续。