撤销职务与免除职务在事业单位中的区别主要体现在性质、适用条件以及后果三个方面：
性质差异：
- 撤销职务：属于行政处分的范畴，具有惩戒性质。它是对事业单位工作人员在履职过程中出现的严重违法、违纪或严重不称职等行为的否定和制裁。
- 免除职务：是法定的人事处理种类之一，不具有惩戒性。它是基于多种正常原因（如工作调动、机构调整、任职期满、退休等）而进行的人事调整。
适用条件不同：
- 撤销职务：主要适用于那些因严重违纪违法行为给事业单位或国家和人民利益造成重大损失或严重后果的工作人员。这些行为可能包括贪污受贿、滥用职权、玩忽职守等。
- 免除职务：则可能由于多种正常的人事变动原因而实施，如工作人员的职位转换、晋升或降低职务、离职学习、健康原因不能坚持正常工作、调出事业单位、退休等。此外，当工作人员受到刑事处罚、行政撤职或开除处分、被辞退、因机构变动失去职位或死亡时，其职务也会自行免除。
后果差异：
- 撤销职务：受撤职处分的工作人员通常会面临严重的政治和经济后果。政治上，他们的声誉和政治地位会遭受重大打击；经济上，他们的工资、奖金、福利等通常会大幅降低，因为职务撤销往往伴随着级别降低和相关经济待遇的减少。同时，撤职处分的期限通常为2年，期间不得晋升职务、级别和工资档次。即使处分期满解除后，也不视为恢复原职务、原级别。
- 免除职务：对于免去现任职务的工作人员而言，如果这是基于正常的人事调动或组织安排，那么他们通常不会面临严重的政治和经济后果。他们的级别和工作一般不受影响，且有可能在新岗位上获得发展机会。然而，如果是因受到刑事处罚、行政撤职等而导致的职务自行免除，则其级别和工资可能会受到影响，甚至可能丧失公职、失去工作。
综上所述，撤销职务与免除职务在事业单位中具有截然不同的性质、适用条件和后果。撤销职务是一种严厉的行政惩戒措施，旨在对工作人员的严重过错进行制裁；而免除职务则更多是一种正常的人事调整手段，旨在优化人力资源配置。