当人民法院查到调解案件时，会根据具体情况进行不同的处理。以下是我基于多领域法律实务经验给出的详细解答：

1. 确认调解协议效力：

   • 人民法院首先会审查调解协议的合法性、真实性和有效性。如果调解协议符合法律规定，没有违反自愿、合法原则，且内容明确、具体，人民法院会确认其效力。
   • 一旦调解协议被确认有效，当事人应当按照协议内容履行义务。如果一方拒绝履行，另一方可以向人民法院申请强制执行。

2. 调解协议存在问题：

   • 如果人民法院在审查过程中发现调解协议存在问题，如违反法律规定、侵犯他人合法权益、内容不明确或存在欺诈、胁迫等情形，人民法院可能会裁定调解协议无效或部分无效。
   • 在这种情况下，当事人可以重新协商达成新的调解协议，或者通过诉讼程序解决争议。

3. 调解案件与诉讼程序的关系：

   • 调解是诉讼程序中的一种替代性纠纷解决方式。如果调解成功，可以避免诉讼程序的繁琐和耗时。
   • 但是，如果调解不成或者调解协议被确认无效，当事人仍然有权向人民法院提起诉讼，通过诉讼程序解决争议。

4. 特殊情况的处理：

   • 在某些特殊情况下，如涉及国家利益、社会公共利益或者他人合法权益的调解案件，人民法院可能会主动介入，对调解协议进行更为严格的审查。
   • 如果发现调解协议存在损害国家利益、社会公共利益或者他人合法权益的情形，人民法院会依法予以纠正。

综上所述，当人民法院查到调解案件时，会根据调解协议的合法性、真实性和有效性进行审查，并根据审查结果作出相应的处理。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。