商铺租赁个人所得税的计算涉及多个方面，以下是详细的解答：

一、纳税义务人

个人出租商铺取得租金收入时，该个人即为个人所得税的纳税义务人，需要按照法律规定履行纳税义务。

二、应税项目与税率

个人出租商铺取得的租金收入属于“财产租赁所得”项目，适用税率为20%的比例税率。

三、应纳税所得额的计算

1. 收入确定：

   • 每次（月）收入不超过4000元的，减除费用800元；
   • 每次（月）收入超过4000元的，减除20%的费用。

2. 允许扣除的项目：

   • 税费扣除：包括已缴纳的增值税、城市维护建设税、教育费附加、房产税、印花税等；
   • 租金扣除：如果是转租商铺，那么向出租方支付的租金可以在计算应纳税所得额时扣除；
   • 修缮费用扣除：每次修缮费用最多可以扣除800元，如果一次扣不完，可以在下次继续扣除，直到扣完为止。

3. 计算公式：

   • 每次（月）收入不超过4000元：应纳税所得额 = 收入 - 准予扣除项目 - 修缮费用（≤800元） - 800元；
   • 每次（月）收入超过4000元：应纳税所得额 = （收入 - 准予扣除项目 - 修缮费用（≤800元））×（1 - 20%）。

四、应纳税额的计算

应纳税额 = 应纳税所得额 × 20%。

五、缴纳方式与时间

• 缴纳方式：纳税人可以自行申报缴纳，或者由支付租金的单位/个人代扣代缴；
• 缴纳时间：取得所得的次月15日内需要申报缴纳；如果是按年取得租金收入的，那么在次年3月31日前需要办理汇算清缴。

六、特殊注意事项

• 地区差异：不同地区的税收政策可能会有所不同，建议咨询当地税务机关以获取最准确的信息；
• 凭证保管：务必妥善保存租赁合同、租金收据、税费缴纳凭证等相关资料，以备不时之需；
• 特殊情况处理：对于外籍个人、港澳台同胞或合作/联营出租等特殊情况，需要遵循特定的税收政策和程序，建议咨询专业的税务机构或律师。

举例说明

假设小李出租商铺，每月租金为5000元，当月缴纳税费300元，发生修缮费用1000元。那么他的应纳税所得额和应纳税额计算如下：

• 可扣除修缮费用800元（因为限额为800元）；
• 应纳税所得额 =（5000 - 300 - 800）×（1 - 20%）= 2960元；
• 应纳税额 = 2960 × 20% = 592元。

因此，小李当月需要缴纳的个人所得税为592元。