医院收费窗口存在的问题主要涉及到收费不合规，这些不合规行为可能表现为多种形式，以下是对这些问题的详细归纳以及相应的整改措施：

一、存在的问题

1. 超标准收费：

   • 部分医院对某些医疗服务项目收取的费用超过了国家规定的标准。

2. 重复收费：

   • 对同一医疗服务项目重复计费，或者在患者住院期间对某些日常服务重复收取费用。

3. 分解收费：

   • 将一个完整的医疗服务项目不合理地拆分成几个部分，分别收费，从而增加患者的总费用。

4. 擅自设立收费项目：

   • 部分医院在没有得到相关部门批准的情况下，擅自设立新的收费项目。

5. 药品和医用耗材加价收费：

   • 医院不按规定加价率销售药品和医用耗材，获取额外利润。

二、整改措施

1. 完善收费制度：

   • 医院应明确收费标准，规范收费行为，制定并公布详细的医疗服务收费标准，确保医院和患者都能明确了解各项服务的费用。

2. 加强内部审计与监管：

   • 医院应完善内部审计制度，确保内审工作的独立性和有效性，加强对收费行为的内部监管。
   • 主管部门应加强对医院的监管力度，实施常态化的监督与检查，对违规行为进行严肃处理。

3. 严格执行医疗服务价格管理政策：

   • 建立健全医疗服务收费内部监控机制和管理制度，提高依法收费的自觉性。
   • 严格执行医疗收费价格及药品价格公示制度、费用清单和查询制度，增加收费透明度。

4. 完善医药费用管控措施：

   • 科学测算，合理确定医院医疗费用控制的年度和阶段性目标。
   • 利用医疗保险支付方式改革对医疗服务行为和费用的调控引导与监督制约作用，建立医务人员合理检查、合理用药、合理治疗的内在激励机制。

5. 加强医德医风考评与教育培训：

   • 切实加强医院文化建设和医务人员医德医风教育，始终把患者的利益放在首位。
   • 将医务人员的诊疗行为纳入医院考核范围，与医务人员的评优、评先、晋升职称挂钩。

6. 强化外部监管与问责机制：

   • 相关职能部门要切实履行对医院的监管职能，积极探索科学的医院监管方式。
   • 建立考核问责机制，将医疗费用控制目标纳入医院综合目标管理责任制等指标体系严加考核。

综上所述，解决医院收费窗口存在的问题需要医院自身加强管理和监管，同时主管部门也应加强外部监管力度，共同维护医疗收费的合规性和患者的合法权益。