当您遇到主动离职但公司不同意的情况时，您可以按照以下步骤来处理：
首先，明确您的辞职权利。根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动者有权提前30日以书面形式通知用人单位解除劳动合同，这是您的法定权利，无需单位同意。在试用期内，这一提前通知期限缩短为3天。
接下来，确保您以书面形式向公司提交辞职信或辞职报告，并保留好相关证据，如快递单号、挂号信回执等，以证明您已经按照法律规定提前通知了公司。
如果公司在您提交辞职信后仍然不同意您离职，并且拒绝办理离职手续或扣发工资，您可以采取以下措施：
与公司协商：首先尝试与公司进行友好协商，解释您的离职原因，并请求公司按照法律规定办理离职手续并支付应得的工资。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并督促公司履行法律义务。
申请劳动仲裁：如果劳动监察部门的处理未能满足您的要求，或者公司拒绝履行劳动仲裁裁决，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。
此外，还需要注意以下几点：
特殊约定：如果您与公司签订了特殊约定，如服务期协议、竞业限制协议等，您需要按照约定履行相关义务，不能单纯以30日期满为由不再上班。
工作交接：在离职前，您需要积极配合公司完成工作交接，确保工作的连续性和稳定性。如果因未妥善交接给公司造成损失，您可能需要承担赔偿责任。
住房问题：如果您住在公司分配的住房中，离职时是否需要交还住房应根据您与公司之间的约定或住房性质来判断。如果有书面协议且约定了离职时公司有权收回住房，那么公司可以按照约定收回。如果没有此类约定，则需要根据住房的具体性质来判断。
总之，面对公司不同意离职的情况，您应保持冷静并依法行事。通过书面通知、保留证据、与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等步骤来维护自己的合法权益。