协会在收取会费时，开票的具体方式需根据其组织性质、是否提供应税服务或销售货物等因素来确定。以下是对协会会费开票问题的详细解答：

一、非营利性会费处理

对于非营利性的协会会费，通常应开具社会团体会费专用收据而非增值税发票。这是因为根据相关规定，如《关于进一步明确全面推开营改增试点有关再保险、不动产租赁和非学历教育等政策的通知》（财税〔2016〕68号）第五条，各党派、共青团、工会、妇联等社会团体收取的会费属于非经营活动，不征收增值税。因此，这部分会费应使用由财政部门监制的社会团体会费专用收据作为合法依据。

二、社会团体会费专用收据的意义与使用

• 对协会的意义：该收据是记录会费收入的合法依据，有助于规范协会的财务管理，并满足财务核算和审计的要求。
• 对会员的意义：它是会员履行会员义务的有效证明，且在企业所得税税前扣除等方面，可以作为扣除的合法凭证。
• 使用规定：根据《关于进一步规范社会团体会费票据使用管理的通知》，依法成立的社会团体向会员收取会费时，必须使用社会团体会费统一票据。此票据是社会团体会费收支的法定凭证和会计核算的原始凭证。

三、应税服务的特殊处理

如果协会除了收取会费外，还提供了应税服务（如培训、咨询等）或销售货物等增值税应税行为，那么对于这部分业务，应当按照规定开具增值税发票。这意味着协会需要区分会费收入与应税服务收入，并分别开具不同的票据。

四、特殊情况与地域差异

• 特殊情况：如协会同时有非营利性会费收入和应税服务收入，应确保分别开具社会团体会费专用收据和增值税发票，以清晰区分不同性质的收入。
• 地域差异：由于不同地方可能存在政策上的差异，建议协会在确定开票方式前，咨询当地的税务部门或专业机构，以确保符合当地的具体规定和要求。

五、操作建议与注意事项

• 合规性检查：协会应确保所使用的收据或发票均合法合规，避免使用不合规的票据带来的法律风险。
• 财务管理：加强财务管理，确保会费收入与应税服务收入的清晰区分和正确核算。
• 税务咨询：在遇到不确定的开票情况时，及时咨询税务部门或专业机构，以获得准确的指导和帮助。同时，也要关注税务政策的更新和变化，以确保协会的税务处理始终符合最新规定。

综上所述，协会在收取会费及提供应税服务时，应根据具体情况选择合适的开票方式，并确保所有操作均符合相关法律法规的规定。