夫妻两年没有在一起，可以通过以下两种方式来处理离婚事宜：

一、协议离婚

1. 协商一致：夫妻双方需要就离婚、子女抚养、财产及债务处理等事项达成一致意见。
2. 签订协议：根据协商结果，签订书面离婚协议，明确双方的权利和义务。
3. 申请离婚登记：双方需共同到婚姻登记机关申请离婚登记，并提交离婚协议和相关证件。
4. 冷静期：自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。
5. 领取离婚证：冷静期届满后三十日内，双方需共同到婚姻登记机关申请发给离婚证。经审查符合条件的，婚姻登记机关会予以登记，并发给离婚证。

二、诉讼离婚

1. 准备材料：一方需撰写民事起诉状，并收集能证明夫妻感情破裂的证据，如分居协议、租房合同、证人证言等。同时，准备身份证、结婚证等必要证件。
2. 立案：向有管辖权的法院（一般是被告住所地法院）递交起诉状和证据材料。法院会审查是否符合立案条件，并作出相应裁定。
3. 调解：法院受理案件后，会先进行调解，尝试促使双方和解或达成离婚协议。
4. 审理与判决：如果调解不成，法院将进入审理阶段。双方需参加庭审，进行举证、质证和辩论。法院将根据审理情况和相关法律规定，作出是否准予离婚的判决。

在诉讼离婚中，因感情不和分居满两年是认定夫妻感情破裂的情形之一。因此，提供充分的分居证据对于诉讼离婚的成功至关重要。

注意事项

1. 财产分割：离婚时，夫妻双方需协商处理共同财产。如果协商不成，法院将根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。
2. 子女抚养：对于子女的抚养问题，双方也需协商一致。如果协商不成，法院将根据子女的利益和双方的实际情况来判定抚养权的归属和抚养费的支付。

总之，夫妻两年没有在一起可以通过协议离婚或诉讼离婚的方式来解除婚姻关系。在具体操作中，建议咨询专业律师以获取更详细的法律指导和帮助。