当发票企业与实际支付企业不一致时，发票的开具应遵循实际业务发生的原则。根据国家税务总局的明确指示，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务收取款项时，应按照实际业务由提供服务一方向接受服务一方开具发票。

这意味着，在实际业务中，如果付款方和实际购买方（即接受服务方）不一致，发票应当开给实际接受服务的一方。例如，如果A公司需要安装一部电梯，并找到了B公司进行安装，但安装完成后是由C公司支付了安装费用，那么B公司应当将发票开给实际接受服务的A公司，而不是付款的C公司。

此外，值得注意的是，“四流一致”（即合同流、资金流、票流和货物流的统一）是税务部门在稽查时的一个重要依据。然而，并非所有情况下都必须严格遵守“四流一致”。在真实业务发生的前提下，即使资金流与发票流不一致，只要业务是真实的，并且发票是开给实际接受服务的一方的，那么这种情况是被允许的。

总的来说，处理发票企业与实际支付企业不一致的情况时，应关注业务的真实性，并确保发票是开给实际接受服务的一方的。这样可以有效避免涉及虚开发票等税务风险。同时，企业在日常经营中也应加强财务管理和内部控制，确保发票的合规性。