当您的套牌两轮电动车被交警抓获时，您将面临一系列的法律后果和处理流程。以下是对此情况的详细解答：
一、主要处罚措施
罚款：
- 套牌行为被抓后，您可能会面临一定金额的罚款，具体数额依据当地交通法规而定，但通常会在几百元到上千元不等。
收缴套牌与扣车：
- 交警会依法收缴套牌，并扣留您的电动车，以防止套牌继续流通使用。
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，使用伪造、变造机动车号牌的车辆，公安机关交通管理部门有权扣留。
行政拘留：
- 如果套牌行为情节严重，如多次套牌、抗拒执法等，您可能会面临十五日以下的行政拘留。
刑事责任：
- 若套牌行为涉及其他刑事犯罪，如盗窃、诈骗等，您还将被依法追究刑事责任。
二、电动车类型的影响
- 对于非机动车（符合新国标标准的电动车），虽然国家尚未推出针对非机动车套牌的明确规定，但地方可能会根据具体情况制定相应的处罚制度。
- 对于机动车（时速快、重量大的电动车），套牌行为的处理将严格按照机动车的处罚规定执行。
三、特殊情况处理
不知情购买套牌二手车：
- 如果您是在不知情的情况下购买了使用套牌的二手车，可以向交警说明情况，并提供购车凭证等相关证据，以争取从轻处理。
证明套牌非自己所为：
- 如果您能证明套牌行为并非自己所为，例如套牌是在车辆被盗抢期间被他人使用等，可以依据事实和证据向交警部门反映，以维护自身权益。
合法证明或补办手续：
- 如果您能够提供相应的合法证明或者补办相应手续，证明您的电动车并非套牌车，公安机关交通管理部门应当及时退还您的电动车。
四、后续建议
- 遵守法律法规：强烈建议您遵守相关法律法规，不要使用套牌电动车，以确保自己和他人的安全。
- 仔细核查车辆信息：在购买二手电动车时，应仔细核查车辆信息，避免购买到套牌车。
- 积极配合调查：若不慎涉及套牌问题，应积极配合交警调查，提供相关证据，以争取合理的处理结果。
总之，套牌行为是违法的，一旦被抓将面临严格的处罚。因此，请务必遵守相关法律法规，确保您的电动车合法上路。