发票丢失后，是否可以使用存根联复印件进行报销，这主要取决于企业内部规定、税务法规以及操作的合规性。以下是对此问题的详细解答：
一、企业内部规定与操作流程
查看企业内部规定：首先，需要查阅您所在企业的财务制度或相关规定，了解是否允许在发票原件丢失的情况下使用复印件进行报销。如果企业有明确规定，并且您按照企业要求完成了相关审批和说明手续，那么使用存根联复印件进行报销可能是被允许的。
获取必要证明：为了证明发票的真实性，您需要取得原签发单位盖有公章的证明，该证明应注明原发票的号码、金额和内容等。同时，您还需要联系发票开具单位，请求他们提供发票存根联或记账联的复印件，并加盖出票单位的发票专用章或财务章。
提交审核：将上述材料（包括发票存根联复印件、原签发单位的证明、情况说明等）提交给单位的主管领导或财务部门进行审核。如果审核通过，您可能就可以使用存根联复印件进行报销了。
二、税务法规层面的处理
增值税普通发票：对于增值税普通发票，如果存根联复印件清晰且能与税务机关系统中的发票信息比对核实，那么它可能可以用于报销并在企业所得税前扣除。但您可能还需要根据税务机关的要求提供其他佐证材料。
增值税专用发票：对于增值税专用发票，如果丢失前已认证相符，您可能可以凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》作为增值税进项税额的抵扣凭证。如果丢失前未认证，您则需要先凭销售方提供的专用发票记账联复印件进行认证，然后再按上述方式处理。
三、法律合规性与风险管理
在处理发票丢失的报销问题时，必须严格遵守相关法律法规和企业的报销政策。发票丢失后，您还应及时向税务机关报告并可能需要登报声明作废。这是为了避免潜在的税务风险和法律责任。
总结
综上所述，发票丢失后使用存根联复印件进行报销是有可能实现的，但这需要您遵循企业内部规定、税务法规以及法律合规性的要求。同时，您还需要确保所提交的材料真实、完整且能有效证明发票的真实性。在实际操作中，建议您事先与主管税务机关或企业财务部门沟通确认，以确保操作的合规性并降低风险。