公司拥有的房产确实需要缴纳土地使用税。这是基于《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》的明确规定，如果公司房产坐落在城市、县城、建制镇、工矿区范围内，那么公司作为土地的实际使用者，有义务按规定缴纳土地使用税。

关于土地使用税的计税依据与税额计算，它是以实际占用的土地面积为计税依据的。通常，土地面积会以土地管理部门核发的土地使用证书上确认的面积为准。如果尚未核发土地使用证书，纳税人则需要据实申报土地面积，并在核发后进行调整。税额的计算是基于实际占用的土地面积和单位税额来确定的，单位税额会因城市规模（如大城市、中等城市、小城市）和土地等级的不同而有所区别，具体税额由各省、自治区、直辖市人民政府在规定幅度内确定。

此外，也存在一些法定的免税情形，如国家机关、人民团体、军队自用的土地，以及由国家财政部门拨付事业经费的单位自用的土地等，均可免征城镇土地使用税。如果公司房产土地符合这些免税条件，可以按规定申请减免。

为了避免不必要的法律风险和经济损失，建议公司及时了解当地的税收政策，并确保合规缴税。对于税额计算、申报流程等具体操作细节，如有疑问，应及时咨询专业律师或税务机构，以确保税务处理的准确性和合法性。总的来说，缴纳土地使用税是公司作为土地使用者应尽的义务，也是国家为了合理、节约使用土地而采取的一项重要措施。