如果您有团员证但团员档案遗失了，您可以按照以下步骤进行处理：
首先，您需要确认自己的团员身份是否依然有效。通常，团员年满28周岁且没有担任团内职务时，应该办理离团手续。因此，如果您仍在28周岁以下且未办理离团手续，您的团员身份应该是有效的。
接下来，针对团员档案的遗失，您可以向其隶属团组织或入团时所在单位团组织寻求帮助，他们可以为您出具团员身份证明或补办相关档案材料。补办团员档案时，需要注意以下几点：
核实身份：确保您的团员身份核实无误，这是补办档案的前提。
补办材料：根据团组织的指导，您可以补办团员登记表、团员证等作为团员身份证明。但需要注意的是，通常不补办入团志愿书，因为入团志愿书是首要团员档案，具有独特的性和历史价值。
真实可信：补办团员档案及相关证明材料必须真实可信。提供虚假材料和档案将追究相关单位和个人的责任，因此请务必确保所提供信息的真实性。
团组织管理：补办完成后，您的团员档案将由相应的团组织进行管理。如果您是学生团员，档案通常纳入学籍档案进行管理；如果您已建立人事档案，则由具备人事档案管理权限的用人单位或相关服务机构统一管理；如果您未建立人事档案，则由县级团委或相关团组织统一管理。
总之，虽然团员档案的遗失可能会带来一些不便，但通过与团组织的沟通和协作，您可以补办相关档案材料并继续保留您的团员身份。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时联系您所在团组织或上级团组织进行咨询。