如果你的手机在刑事案件中被扣押，但里面存有民事案件的重要证据，你可以采取以下措施：

1. 及时与扣押机关沟通：

   • 首先，你应当尽快与扣押你手机的刑事侦查机关（如公安局）取得联系，向他们说明手机中存有与民事案件相关的重要证据，并请求他们允许你提取这些证据或允许你的律师代为提取。
   • 在沟通时，务必保持冷静和礼貌，并准备好相关的证明材料，如民事案件的起诉状、法院受理通知书等，以证明你提取证据的正当性和紧迫性。

2. 申请法院协助：

   • 如果扣押机关不同意你提取证据，或者你认为他们的处理不够及时，你可以考虑向受理民事案件的法院提出申请，请求法院协助你提取手机中的证据。
   • 法院在收到你的申请后，会根据具体情况作出决定，可能会向扣押机关发出协助执行通知书，要求他们配合你提取证据。

3. 寻求律师帮助：

   • 在整个过程中，你可以寻求专业律师的帮助。律师不仅可以帮助你与扣押机关和法院进行沟通，还可以为你提供法律建议，确保你的权益得到充分保护。
   • 律师还可以根据你提供的证据材料，为你分析民事案件的可能走向和应对策略。

4. 注意证据保全：

   • 在提取证据时，务必确保证据的完整性和真实性。你可以通过拍照、录像等方式对证据进行固定和保全，以防止证据在后续诉讼过程中被篡改或灭失。

5. 考虑其他证据：

   • 如果手机中的证据无法及时提取，你也不要过于担心。你可以尝试寻找其他能够证明你主张的证据，如证人证言、书证、物证等。这些证据同样可以在民事诉讼中发挥重要作用。

综上所述，虽然手机被扣押可能会给你的民事诉讼带来一定困扰，但只要你及时采取措施，与扣押机关和法院保持沟通，并寻求专业律师的帮助，你仍然有可能成功提取到手机中的证据，并维护自己的合法权益。