不能直接推定配偶为共同借款人。具体分析如下：

在民间借贷关系中，借条是证明借贷关系存在的重要证据。当配偶在借条底部签字，但未明确注明其身份是担保人、见证人还是共同借款人时，我们不能仅凭签字行为就推定其为共同借款人。

1. 签字性质的多样性：配偶在借条上签字，可能出于多种原因和身份。例如，配偶可能作为见证人，确认借款事实的存在；也可能作为担保人，为借款人的债务提供担保。因此，仅凭签字行为，无法准确判断配偶的真实意图和身份。

2. 共同借款人的认定标准：共同借款人通常是指在借款合同中明确与借款人一起承担还款责任的主体。在借条上，如果配偶被明确标注为“共同借款人”或类似身份，并且签字确认，那么可以认定其为共同借款人。但在本案例中，配偶的签字并未明确其身份，因此不能直接推定其为共同借款人。

3. 法律证据的严谨性：在法律上，证据的认定需要严谨和明确。对于配偶在借条上的签字，如果没有其他证据（如借款合同、聊天记录、录音等）佐证其共同借款的意图，那么仅凭签字行为是无法直接推定其为共同借款人的。

综上所述，配偶在借条底部签字，但未写明是担保人还是见证人时，我们不能直接推定其为共同借款人。在处理此类纠纷时，应综合考虑借条的内容、签字的位置和方式、当事人的陈述以及其他相关证据，以准确判断配偶的身份和责任。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。