《行政机关公务员处分条例》删除替代的法律是《中华人民共和国公职人员政务处分法》。以下是详细的解释：
一、替代背景
《行政机关公务员处分条例》自2025年1月20日起废止，其主要原因在于：
法律法规的更新完善：随着《中华人民共和国公职人员政务处分法》的出台，该法对公职人员政务处分作出了更为系统、全面和具体的规定，涵盖了行政机关公务员在内的所有公职人员，实现了对公职人员监督管理的统一和规范。与《行政机关公务员处分条例》相比，《政务处分法》在处分的种类、适用规则、程序等方面更加科学合理，具有更强的针对性和可操作性。
机构改革的需要：党和国家机构改革后，行政管理体制和公务员管理机制发生了变化，原有的一些规定与新的机构设置、职能配置和工作流程可能不再适配，需要对相关行政法规进行清理和调整，以确保法规制度与实际工作的紧密衔接和有效运行。
推进法治建设的要求：随着法治建设的不断推进，对行政法规的质量和协调性提出了更高的要求。废止《行政机关公务员处分条例》有助于进一步优化行政法规体系，减少法规之间的重复和冲突，提高法规的整体质量和效力。
二、替代后的影响
《中华人民共和国公职人员政务处分法》的实施，为行政机关公务员的管理提供了更加清晰、明确和有效的法律依据，促进了严格规范公正文明执法。同时，该法也加强了对公职人员的监督和管理，对于维护公职人员的廉洁性和公信力具有重要意义。
综上所述，《行政机关公务员处分条例》的删除替代是法律法规更新完善、机构改革需要和推进法治建设要求的必然结果。替代后的《中华人民共和国公职人员政务处分法》将为公职人员的管理提供更加全面、科学和有效的制度保障。如果您在该领域有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。