风电工程的管理部门主要涉及国家能源局以及各省、自治区、直辖市的发展改革委（能源局）。具体来说：
国家层面：国家能源局是负责全国风电建设管理的行政主管部门，会发布关于风电建设管理的相关通知和要求，如《国家能源局关于2018年度风电建设管理有关要求的通知》等，对风电工程的规划、建设、消纳等方面进行指导和监管。
地方层面：各省、自治区、直辖市的发展改革委（能源局）则是本地区风电工程前期工作的行政主管部门，负责组织编制本地区的风电场工程规划，以及风电项目的前期工作管理，如预可行性研究、可行性研究等阶段的审批和监管。
综上所述，风电工程的管理部门是国家能源局以及各省、自治区、直辖市的发展改革委（能源局），它们共同负责风电工程的规划、建设、管理和监督等工作。如果你有更具体的问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。