要查询员工在什么单位报过个税，可以通过以下几种方式进行：

一、使用个人所得税APP

个人所得税APP是国家税务总局推出的官方应用，提供了丰富的税收管理功能。员工可以通过该APP的“任职受雇信息”功能查看自己的任职受雇单位情况，包括曾经和当前在职的单位。如果发现有未知或错误的单位信息，还可以通过APP内的“申诉”功能进行申诉处理。

操作步骤：

1. 下载并安装个人所得税APP。
2. 注册并登录账号，完成身份认证。
3. 在APP首页或个人中心页面，找到“任职受雇信息”选项。
4. 点击进入后，即可查看员工的任职受雇单位列表。

二、访问国家税务总局电子税务局或自然人电子税务局

除了个人所得税APP，员工还可以通过国家税务总局电子税务局（https://etax.chinatax.gov.cn）或自然人电子税务局（同样网址）的官方网站进行查询。这些网站提供了与APP类似的功能，包括涉税信息查询、税费缴纳等。

操作步骤：

1. 访问国家税务总局电子税务局或自然人电子税务局的官方网站。
2. 登录个人账号，完成身份认证。
3. 在网站首页或个人中心页面，找到“任职受雇信息”或“涉税信息查询”选项。
4. 点击进入后，根据提示进行查询。

三、咨询主管税务机关

如果员工对以上方式查询到的结果有异议，或者需要更详细的涉税信息，可以咨询主管税务机关。员工需要携带有效身份证件和相关证明材料，前往当地税务局的办税服务厅进行咨询和申请。

注意事项：

1. 在查询过程中，请确保个人信息的准确性和安全性。
2. 如果发现个人信息被冒用或存在其他异常情况，应及时向税务机关进行申诉和处理。
3. 涉税信息查询服务是税务机关依法提供的，员工应合理使用并遵守相关法律法规。

综上所述，员工可以通过个人所得税APP、国家税务总局电子税务局或自然人电子税务局的官方网站以及咨询主管税务机关等方式来查询自己在什么单位报过个税。