是的，水上娱乐设施运营需要办理营业执照。根据相关法律法规，如《中华人民共和国海上交通安全法》以及地方性的管理办法，比如《深圳市海上休闲船舶运营安全管理办法》，使用休闲船舶从事经营性海上休闲活动的，应当依法进行商事登记，取得营业执照，这是合法经营的基本要求。

具体来说，在办理营业执照的过程中，你可能需要准备一些必要的材料，这些材料可能包括但不限于经营人的商事登记信息、从事经营的休闲船舶信息、船员及其他经营管理人员的信息，以及安全生产责任制度、安全与防污染管理制度和应急预案等相关的安全生产管理制度。这些信息的提交是为了确保你的经营活动符合法律法规的要求，同时也是为了保障消费者和经营者自身的安全。

此外，值得注意的是，除了营业执照之外，根据具体的经营内容和所在地的法律法规，你可能还需要办理其他的相关证照或许可，比如公共场所卫生许可证、经营高危险性体育项目许可证等。这些证照的办理流程和所需材料可能因地区而异，因此建议你在办理前咨询当地的相关部门或专业机构，以获取最准确的信息和指导。

总的来说，办理营业执照是水上娱乐设施运营的必要步骤，它不仅是合法经营的前提，也是保障经营者和消费者权益的重要措施。在办理过程中，请务必遵循相关的法律法规和程序要求，确保你的经营活动合法、安全、有序地进行。