关于灵活就业社保当月申请当月扣费的问题，这主要取决于具体的地区规定和社保系统的操作流程。以下是一般情况下的说明：

在大多数地区，灵活就业人员申请社保后，扣费通常不会立即进行，而是遵循一定的时间节点和流程。具体来说，社保费用的扣缴一般会根据当地税务或社保部门的规定，在每月的特定时间段内进行。例如，有些地区规定每月的1日至月末为社保费征缴期，而实际扣费可能会在这个时间段内的某个具体日期或分批次进行。

对于当月申请社保的灵活就业人员，如果申请时间处于征缴期内，并且成功完成了社保登记和缴费申报，那么当月是有可能进行扣费的。但需要注意的是，并非所有地区都保证当月申请当月扣费，这取决于当地社保系统的处理速度和规定。

为了确保社保费用的顺利扣缴，建议灵活就业人员：

1. 提前了解当地社保费征缴的具体时间和流程；
2. 在申请社保时，仔细核对个人信息和缴费金额，确保无误；
3. 保持银行账户余额充足，以便在扣费时能够顺利划款；
4. 密切关注社保缴费情况，如发现异常或未成功扣费，及时与当地社保或税务部门联系处理。

综上所述，灵活就业社保当月申请当月是否扣费，需根据当地的具体规定和操作流程来确定。建议灵活就业人员提前了解并关注相关信息，以确保社保费用的正常缴纳。