您好，关于灵活就业人员基本养老保险统筹部分是否可以在个税中扣除的问题，我为您整理了以下详细解答：

首先，根据财税【2006】10号文件的第一条规定，个人按照国家或省（自治区、直辖市）人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费，是允许在个人应纳所得税额中扣除的。这意味着，如果您作为灵活就业人员，按照规定的缴费比例或办法自行缴纳了基本养老保险费，那么这部分费用是可以在计算个人所得税时进行税前扣除的。

此外，值得注意的是，近年来国家还推出了个人养老金制度，并配套了相应的个人所得税优惠政策。根据财政部、税务总局的相关公告，个人向个人养老金资金账户的缴费，在一定限额内（目前为每年12000元）也是可以在综合所得或经营所得中据实扣除的。不过，这一优惠政策与个人基本养老保险的税前扣除是两个不同的政策，分别适用不同的规定和操作流程。

综上所述，灵活就业人员基本养老保险统筹部分确实可以在个税中进行扣除，这是国家为了鼓励个人参与社会保障、减轻个人税收负担而制定的政策。同时，如果您还参与了个人养老金制度，也可以享受相应的税前扣除优惠。在具体操作时，建议您咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保准确理解和应用相关政策。