法院拍卖来的违建确实存在被拆除的可能性，但具体是否会拆除以及如何处理，需依据实际情况和法定程序来判断。
违章建筑的性质：
- 违章建筑是指违反法律法规及相关规定所建造的建筑物，其本身不具有合法性。若违章建筑在拍卖前已有相关部门的有效强拆决定，且满足法定条件，那么实施强拆是可能的。
拍卖过程中的告知义务：
- 法院在拍卖时应明确告知竞拍者该建筑为违章建筑。若未能明确告知，或涉及到其他可能影响强拆合法性的问题，竞买者有权视情况提起诉讼，以维护自己的权益，例如请求撤销拍卖、获取相应损失赔偿等。
强拆的法定程序：
- 即使违章建筑需要被拆除，也必须依法依规执行程序。若强拆过程中存在违法行为，并对当事人造成了财产损失，当事人有权提出赔偿请求，赔偿内容可能包括建筑物本身价值和室内物品损失等直接损失。
特殊情况的处理：
- 在某些特殊情况下，如违章建筑的历史遗留问题、政策调整等，可能会影响强拆的决定和执行。因此，具体处理还需结合多种因素进行全面评估。
综上所述，法院拍卖来的违建是否会拆除，取决于多种因素和法定程序。若您面临此类问题，建议咨询当地相关部门或专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。