当公司倒闭时，员工的赔偿问题确实是一个复杂且重要的议题。以下是对此问题的详细解答：
一、赔偿的法律依据与基本原则
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条第五项规定，用人单位被依法宣告破产时，劳动合同终止。
- 同时，该法第四十六条第六项规定，因用人单位被依法宣告破产而终止劳动合同的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。
基本原则：
- 公司倒闭导致劳动合同无法继续，员工因此有权获得经济补偿。
- 补偿的标准主要依据员工的工作年限和工资水平来确定。
二、赔偿范围与具体计算
经济补偿金：
- 计算标准：按照员工在公司工作的年限，每满一年支付一个月工资的经济补偿。对于工作六个月以上但不满一年的员工，按一年计算；对于工作不满六个月的员工，则支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资定义：这里的月工资指的是员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。如果员工的月工资高于当地职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
其他赔偿：
- 如果公司存在拖欠工资、加班费、社保费用等违法行为，员工在清算时有权要求公司优先支付这些款项。
- 若公司倒闭是由于管理层的重大过失或违法行为导致，员工还可以考虑通过法律途径追究相关责任人的法律责任，并要求其承担相应赔偿责任。
三、赔偿程序与注意事项
了解公司状况：
- 员工应密切关注公司的财务状况和经营动态，以便及时采取措施维护自己的权益。
与公司协商：
- 在公司倒闭前，员工可以尝试与公司协商，寻求双方都能接受的解决方案，如协商解除劳动合同并达成经济补偿协议。
法律途径：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付经济补偿金和其他应得赔偿。对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
保留证据：
- 员工应妥善保留与公司签订的劳动合同、工资条、考勤记录等关键证据，以便在需要时证明自己的权益。
关注政府政策：
- 政府可能会出台相关政策来保障失业人员的基本生活需求，如失业保险金、就业培训等。员工可以积极了解并申请这些援助政策。
四、注册资金与员工赔偿的关系
- 值得注意的是，公司注册资金与员工赔偿没有直接关系。赔偿金主要来源于公司财产，包括注册资金转化的公司资产和经营过程中的增值部分。在清算过程中，员工的赔偿款项通常享有较高的优先权。
综上所述，公司倒闭时员工的赔偿问题应依据《劳动合同法》及相关法规处理。员工在面临此类情况时，应及时咨询专业律师或劳动监察部门，了解自己的权益和维权途径。同时，公司也应加强财务管理，确保合法合规经营，以维护员工和自身的合法权益。