灵活就业人员医保改成公司交，确实需要中断原有的灵活就业医保缴费，然后由新单位按照在职职工的方式为您办理医保参保手续。
具体来说，当您从灵活就业状态转为单位职工状态，并与单位签订了劳动合同后，根据法律规定，用人单位有法定义务为您依法缴纳社会保险费，这包括医疗保险。因此，您不能再以灵活就业人员的身份继续参保。
为了顺利过渡到单位医保，您需要按照以下步骤操作：
个人先办停缴：您需要前往原灵活就业医保的缴费机构或相关部门，办理停止缴费的手续，退出灵活就业参保方式。
单位再办就业参保：在您退出灵活就业参保方式后，新单位就可以按照在职职工的方式为您办理医保参保手续。这通常包括填写相关表格、提交必要的证件和资料，以及按照单位的规定缴纳医保费用。
此外，您不必担心原先按灵活就业人员缴纳的医保费用会清零。无论是灵活就业转企业职工缴费还是失业中断缴费，前后的缴费年限和医保个人账户储存额都是累计计算的，不会清零。这意味着您在灵活就业期间缴纳的医保费用将会计入您的总缴费年限和个人账户储存额中，对您未来的医保待遇产生影响。
总之，灵活就业人员医保改成公司交需要中断原有的缴费，并由新单位按照在职职工的方式为您办理医保参保手续。请确保按照相关规定和流程办理，以保障您的医保权益不受影响。