灵活就业者缴纳的医保费用并不都在个人账户。具体解释如下：

首先，需要明确的是，医保分为职工医保和居民医保两种。有工作单位的通常参加的是职工医保，而灵活就业人员也可以选择参加职工医保。居民医保则主要是为没有工作单位的人员设计的。这两种医保在缴费和待遇上存在差异。

对于职工医保，包括灵活就业人员参加的职工医保，其缴费是由个人承担全部费用。这些费用中，一部分会进入统筹基金，用于参保人住院、门诊慢特病等医疗费用的报销；另一部分则会划入个人账户。个人账户的划入标准通常是按照本人参保缴费基数的2%来计入。例如，如果缴费基数是5500元，那么每月个人账户会到账110元（5500*2%）。

而居民医保则只有统筹基金，没有个人账户。也就是说，参加居民医保的人员缴纳的医保资金全部纳入统筹基金，用于医疗费用的报销，个人不设立单独的账户。

因此，对于灵活就业者来说，他们缴纳的医保费用并不都在个人账户，而是有一部分会进入统筹基金。个人账户的资金可以用于支付在定点医疗机构和定点零售药店发生的符合规定的费用，如个人负担的医疗费用、药品费用等。而统筹基金则主要用于医疗费用的报销。

总的来说，灵活就业者缴纳的医保费用在个人账户和统筹基金之间是有分配的，具体比例和金额会根据当地的医保政策而有所不同。如果需要更详细的信息，建议咨询当地的医保机构或相关部门。