当灵活就业人员达到法定退休年龄时，如果发现职工基本医疗保险没有累计缴费满规定的年限（通常为男性满30年、女性满25年，且实际缴费不低于10年，但具体年限可能因地区而异），他们面临几种选择来处理这个问题。

首先，他们可以选择一次性补足剩余的缴费年限。这意味着，根据退休当年的缴费基数，他们需要支付一笔费用来补齐所需的医保年限，之后就能享受退休人员的基本医疗保险待遇。这种方式的优点是一劳永逸，可以立即解决医保年限不足的问题。

然而，对于一些人来说，一次性补足可能是一笔不小的经济负担。在这种情况下，他们可以选择不立即进行一次性补足，而是继续逐年缴纳医疗保险费。这样做的话，他们将继续享受在职人员的基本医疗保险待遇，直到他们缴足所需的年限或者决定进行一次性补缴。这种方式的好处是分摊了经济压力，让退休人员有更多的时间来筹集资金。

另外，对于之前有视同缴费年限的灵活就业人员，他们还可以先申请办理视同缴费年限的认定。如果认定成功，这部分年限可以计入总的医保缴费年限中，从而可能减少需要补缴的年限。

需要注意的是，选择逐年缴纳医疗保险费的人员，在缴费年限满足退休待遇条件之前，需要持续缴纳医保费用。同时，他们也应该关注当地医保政策的变化，以确保自己的权益得到保障。

总的来说，灵活就业人员退休时医保没有交满，是可以选择每年继续缴纳的，直到缴足规定的年限或者选择一次性补足。具体选择哪种方式，需要根据个人的经济状况和实际情况来决定。同时，建议咨询当地的医保机构或相关部门，以获取最准确、最权威的信息和指导。