结论前置：电动自行车违规是否会扣C1驾驶证的分，主要取决于电动自行车的类型以及具体的违规行为。如果电动自行车被认定为非机动车，那么违规不会扣C1驾驶证的分；但如果电动自行车超标，被认定为机动车，那么违规就可能会依据机动车相关法规扣C1驾驶证的分。

一、电动自行车类型与扣分关系

1. 非机动车类电动自行车：

   • 这类电动自行车通常符合国家标准，具备脚踏骑行能力，最高设计车速不超过25km/h，整车质量（含电池）不超过55kg。
   • 违规时，处罚方式主要包括警告、罚款等，不涉及扣C1驾驶证的分。

2. 机动车类电动自行车（超标电动自行车）：

   • 这类电动自行车因速度、质量等超出国家标准，被认定为机动车。
   • 驾驶这类电动自行车违规时，会依据机动车相关法规进行处罚，可能涉及扣C1驾驶证的分。

二、电动自行车违规行为与扣分标准

对于被认定为机动车的电动自行车，其违规行为与扣分标准可能包括：

• 走机动车道、逆行、冲禁令、超载或载人、未戴安全头盔等行为，可能会记3分。
• 冲红灯、饮酒驾驶等行为，可能会记6分。
• 更为严重的违规行为，如污损挪用变造备案标识（号牌）、逾期不履行处罚决定行为，可能会记9分甚至更多。

三、建议

1. 了解车辆性质：在驾驶电动自行车前，应确保了解车辆是否属于机动车范畴，以避免不必要的扣分风险。
2. 遵守交通法规：无论驾驶何种类型的电动自行车，都应严格遵守交通法规，确保行车安全。
3. 关注记分情况：持有C1驾驶证的驾驶人应定期查询自己的记分情况，以便及时采取措施避免记分累积达到12分。

综上所述，电动自行车违规是否会扣C1驾驶证的分，需要综合考虑电动自行车的类型以及具体的违规行为。因此，在驾驶电动自行车时，务必了解相关法律法规并严格遵守，以确保行车安全合法。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。