关于灵活就业者如何停交只交了养老保险的医保问题，这主要取决于您所在地的具体医保政策和操作平台。虽然各地流程可能有所差异，但我可以给您一个大致的指引。
首先，您需要确认自己所在地的医保政策是否允许灵活就业者单独停交医保。在某些地区，灵活就业者的医保和养老保险可能是捆绑在一起的，不能单独停交。但如果您的所在地允许单独停交医保，那么您可以按照以下步骤操作：
一、线上操作
查找线上服务平台：通常，各地医保局或相关政府部门会有官方的线上服务平台或APP，如“贵州医保APP”或支付宝内的“河南医保”等。您需要先找到适用于您所在地的线上服务平台。
登录并查找停保选项：在平台上注册并登录后，查找与灵活就业医保相关的停保或中断参保选项。这通常可以在“医保服务”或“我要办”等菜单下找到。
填写信息并提交：根据平台提示，填写必要的个人信息，如姓名、身份证号、手机号等，并上传可能需要的身份证照片。确认信息无误后，提交停保申请。
确认停保成功：提交申请后，平台会进行审核。审核通过后，您会收到停保成功的通知，或者可以在平台上查询到停保状态。
二、线下操作
如果您不熟悉线上操作，或者所在地没有提供线上停保服务，您也可以选择线下办理。具体步骤如下：
咨询当地医保局：先拨打当地医保局的咨询电话，了解停保的具体流程和所需材料。
准备材料：根据医保局的指示，准备必要的材料，如身份证、社保卡等。
前往医保局办理：携带准备好的材料，前往当地医保局或指定的办理地点进行停保申请。
确认停保成功：办理完成后，向工作人员确认停保是否成功，并妥善保管好相关凭证。
需要注意的是，无论您选择线上还是线下操作，都应该确保所提供的信息准确无误，并按照当地医保局的要求进行办理。另外，停保后可能会影响到您未来的医保待遇和缴费年限等，因此在决定停保前，请务必仔细考虑并咨询当地医保局的相关政策。