父母出钱给儿子买房子，为了日后可能出现的房屋产权纠纷等问题中能够有力地证明父母出资的事实，维护父母的合法权益，可以通过以下多种方式留存证据：
出资证明与资金流转记录
书面出资证明或协议：
- 由父母与儿子共同签订一份书面协议，明确约定父母出资购买房屋的具体金额、出资时间、房屋的归属以及是否是借款等相关内容，并由双方签字确认。
- 如果出资是借款形式，应明确借款金额、用途、还款时间、还款方式及利息等关键信息，并由儿子出具借条。
转账记录：
- 无论是通过银行转账、微信转账、支付宝转账，还是其他电子支付方式，都应保存转账记录，并在转账备注或附言中清晰注明款项用途，如“购房出资”、“房款”或“购房首付款”等。
- 同时，保留转账前后的聊天记录或短信，作为辅助证据，证明转账的意图和用途。
银行贷款出资：
- 如果父母通过银行贷款出资，应保存贷款合同、每月的还款记录（如还款流水、还款短信提醒等），以证明资金来源和出资情况。
购房付款凭证：
- 保留购房时的付款凭证，如购房款的支票存根、汇款单据、POS机刷卡小票等，并在凭证上注明款项的用途为“购房出资”。
- 如果可能，购房发票上也可以要求注明付款人信息，作为出资的直接证明。
资金流水关联：
- 梳理购房过程中的资金流水，确保父母的出资与购房款项之间的关联性清晰可查。
其他证据形式
聊天记录：
- 如果出资过程中有通过聊天软件（如微信、QQ等）进行沟通，应保留相关聊天内容，其中应提及父母出资购房的具体事宜。
证人证言：
- 如有亲友或其他证人在场见证父母出资购房的过程，可以请他们出具证人证言，证明父母出资的事实。证人证言应包含证人的身份信息、见证的具体时间、地点、出资金额及方式等详细信息，并由证人签字确认。
赠与协议（如适用）：
- 如果父母明确表示出资是对儿子的赠与，应签订书面赠与协议，固定证据。赠与协议应明确赠与的财产、赠与的生效条件（如有）、赠与的撤销条件（如有）等内容，并由双方签字确认。
注意事项
- 在收集证据时，应确保所有证据的真实性、合法性和有效性。
- 如有需要，可以咨询专业律师或法律机构，获取更具体的法律建议和帮助，确保留存的证据符合法律要求，能够有效保护各方权益。
综上所述，通过综合运用书面出资证明、转账记录、购房付款凭证、聊天记录、证人证言以及赠与协议（如适用）等多种证据形式，可以构建一个完整且相互印证的证据链，以证明父母出资购房的事实。