法院仲裁和起诉是两种不同的法律纠纷解决方式，它们之间存在显著的区别。以下是对这两者的详细比较：

一、性质不同

1. 起诉：起诉是当事人向法院提起诉讼，由法院依据法律进行裁判。它属于国家司法活动的一部分，具有严格的法律程序和规定。

2. 仲裁：仲裁则是双方当事人自愿将争议提交给专门的仲裁机构，由仲裁机构依据仲裁规则进行裁决。仲裁机构通常是独立于行政机关的第三方机构，以中立的身份对纠纷进行裁决。

二、管辖不同

1. 起诉：起诉一般由法定的管辖法院管辖，遵循严格的地域、级别等管辖规定。当事人需要向有管辖权的法院提起诉讼，法院根据法律规定进行受理和审理。

2. 仲裁：仲裁的管辖则依据仲裁协议确定。双方当事人可以在仲裁协议中约定仲裁机构、仲裁地点等事项，仲裁机构根据双方约定的地点等因素确定管辖。

三、程序不同

1. 起诉：起诉的程序较为复杂，包括立案、审理、判决等多个阶段。每个阶段都有严格的法律程序和规定，需要当事人按照法定程序进行操作。起诉的时间相对较长，可能需要数月甚至数年的时间才能得出最终结果。

2. 仲裁：仲裁的程序相对灵活，一般较为快捷。双方当事人可以协商确定仲裁程序的具体规则和方式，如不公开审理以保护商业秘密和隐私。仲裁机构也会根据双方当事人的约定和仲裁规则进行裁决，通常能在较短的时间内得出结果。

四、法律效力不同

1. 起诉：起诉作出的判决具有终局性，双方必须执行。如果一方不履行判决，另一方可以向法院申请强制执行。起诉的判决结果具有强制力和法律效力，对双方当事人具有约束力。

2. 仲裁：仲裁的裁决同样具有法律效力，一般也可申请法院强制执行。但在某些特殊情况下，可能需要通过特定程序进行确认。例如，如果一方当事人认为仲裁裁决存在法定撤销情形，可以向中级人民法院申请撤销裁决。

综上所述，法院仲裁和起诉在性质、管辖、程序以及法律效力等方面都存在显著的区别。当事人在选择纠纷解决方式时，应根据自身需求和案件特点进行权衡和选择。如果希望快速、私密地解决争议，可以考虑选择仲裁；如果希望通过严格的法律程序和权威的司法判决来解决争议，则可以选择起诉。