个人独资公司缴纳的是个人所得税，而非企业所得税。以下是详细解释：

1. 纳税义务人的界定：

   • 个人独资企业作为非法人组织，其财产为投资人个人所有，不具备独立的法人资格。因此，个人独资企业的投资者是个人所得税的纳税义务人，而不是企业所得税的纳税主体。

2. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国企业所得税法》第一条明确规定，个人独资企业、合伙企业不适用该法，即个人独资企业无需缴纳企业所得税。
   • 同时，《国务院关于个人独资企业和合伙企业征收所得税问题的通知》也明确指出，对个人独资企业和合伙企业停止征收企业所得税，其投资者的生产经营所得，比照个体工商户的生产、经营所得征收个人所得税。

3. 税种的缴纳：

   • 个人独资企业需要缴纳的税种主要是个人所得税，这是基于其投资者从企业中获取的生产经营收益来计算的。
   • 此外，个人独资企业还需缴纳增值税及其附加税，具体税率和免税额度根据企业规模和业务类型确定。

4. 税率与计算方法：

   • 个人独资企业的投资者在每一纳税年度的收入总额减除成本、费用及损失后的余额，视为个人的生产经营所得，并适用5%至35%的五级超额累进税率来计算征收个人所得税。
   • 具体计算公式为：应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数 = （收入 - 成本）× 适用税率 - 速算扣除数。

5. 税收优惠政策：

   • 对于符合条件的小型微型企业，包括某些个人独资企业，国家实施了一系列税收优惠政策，旨在减轻这些企业的税收负担，促进其发展。

综上所述，个人独资公司在税务处理上主要缴纳个人所得税，并需关注增值税及其附加税的缴纳。如有任何税务相关的问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会为您提供专业的解答。