当个人所得税APP显示有收入但实际并未收到款项时，这确实是一个需要关注的问题。以下是我根据专业知识和经验，为您提供的详细解答：

首先，明确结论：遇到这种情况，您应首先与公司财务部门核实情况，确认是否为误报、延迟发放或其他原因。如果确认是公司操作失误或流程延迟，催促其及时更正申报并补发工资。如果涉及身份盗用或税务系统错误，您需要立即向税务机关及银行报案并申诉，同时保留所有相关证据。

接下来，分析可能的原因及解决办法：

1. 公司财务操作失误或流程延迟：

   • 公司财务人员可能在申报个人所得税时录入错误数据，或由于公司内部流程导致工资未能按时发放。
   • 解决办法：与公司财务部门或人力资源部门取得联系，询问工资的具体申报和发放情况，并要求提供工资发放记录、考勤记录等相关资料以核对信息。

2. 身份信息被冒用：

   • 不法企业或个人可能获取您的个人身份信息后进行虚假的工资申报。
   • 解决办法：在个人所得税APP上发起申诉，选择适当的申诉类型并说明原因。同时，向当地税务机关报案，提供相关证据证明您未收到该笔工资。联系银行确保账户安全，如有必要，冻结账户以防止进一步损失。

3. 银行转账问题：

   • 银行系统可能出现故障、维护，或者转账信息填写错误。
   • 解决办法：联系银行客服或前往银行柜台查询，提供个人信息和工资发放相关信息。如是银行系统问题，等待银行解决；如因转账信息错误，根据银行指示进行更正。

4. 税务系统错误：

   • 税务系统在处理过程中可能出现错误，导致个人所得税记录上显示错误的工资信息。
   • 解决办法：联系税务机关进行核实和更正，提供工资单、银行流水等证明文件支持申诉。

注意事项：

• 及时行动：涉及个人所得税的问题可能影响税务记录和信用评级，因此应尽快采取行动解决。
• 保留证据：在整个处理过程中，务必保留好所有相关的证据和文件。
• 专业咨询：如遇复杂情况或难以解决，可直接向我咨询，我会为您提供更详细的建议和帮助。

综上所述，当个人所得税APP显示有收入但实际未收到款项时，您应首先与公司财务部门核实情况，并根据具体原因采取相应的解决办法。同时，保持警惕，确保个人身份信息和银行账户的安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。