信用卡逾期三个月以上还进去的钱，其冲抵顺序通常不是先抵扣本金，而是根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》的相关规定来执行。具体来说：

结论前置：信用卡逾期91天以上的，按照先本金、后应收取利息或各项费用的顺序进行冲还。

详细分析：

1. 还款冲抵顺序的法律依据：

   • 根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第五十七条，发卡行收到持卡人还款时，逾期91天以上的，按照先本金、后应收取利息或各项费用的顺序进行冲还。这意味着，在逾期超过三个月的情况下，你还款时首先会冲抵本金，然后再冲抵利息和其他费用。

2. 实际操作中的注意事项：

   • 虽然法规有明确规定，但实际操作中，银行可能会根据具体情况有所调整。因此，在还款前，建议与银行进行明确沟通，了解具体的还款冲抵顺序和金额，以避免产生不必要的误解或费用。

3. 逾期还款的后果：

   • 信用卡逾期还款不仅会影响你的个人征信记录，还可能导致银行采取法律手段进行催收。严重的逾期行为甚至可能构成信用卡诈骗罪，涉及刑事犯罪。

建议：

• 如果你已经逾期三个月以上，应尽快与银行联系，了解具体的还款细节和冲抵顺序。
• 尽量避免逾期还款，以免产生不必要的费用和信用记录污点。
• 如果确实无法按时还款，可以与银行协商个性化的分期还款方案，以减轻还款压力。

总之，信用卡逾期三个月以上还进去的钱，按照法规规定，通常会先冲抵本金，再冲抵利息和其他费用。但具体操作还需与银行进行明确沟通。