检察院不起诉和撤销案件的主要区别体现在适用阶段、适用对象、使用主体范围以及法律意义上。

1. 适用阶段不同：

   • 撤销案件发生于侦查阶段，当侦查机关发现案件具有某种法定情形，或者经过侦查否定了原来的立案根据时，会作出撤销案件的决定。
   • 不起诉则发生于审查起诉阶段，是检察机关对公安机关侦查终结移送起诉的案件和自行侦查终结的案件进行审查后，认为犯罪嫌疑人的行为不符合起诉条件或没有必要起诉时，作出的不将案件移送法院进行审判而终止诉讼的决定。

2. 适用对象不同：

   • 撤销案件只能由有权立案的机关作出，通常针对的是侦查机关立案侦查的案件。
   • 不起诉决定则可以适用于检察机关自己立案侦查的案件，也可以适用于公安机关立案侦查后移送起诉的案件。

3. 使用主体范围不同：

   • 撤销案件既可以由人民检察院作出，也可以由公安机关作出，这取决于案件的立案机关和侦查进展。
   • 不起诉则只能由人民检察院决定，是检察机关对案件进行审查后作出的法律处理决定。

4. 法律意义不同：

   • 撤销案件具有明显的纠错性质，意味着案件在侦查阶段即被终止，犯罪嫌疑人不承担任何不利后果。
   • 不起诉则具有不能追究、从宽处理和纠错的三种属性。它不仅是检察机关对案件的一种法律处理决定，也体现了对犯罪嫌疑人权益的保护和对诉讼资源的合理利用。

综上所述，检察院不起诉和撤销案件在适用阶段、适用对象、使用主体范围以及法律意义上均存在显著差异。这两种处理决定都是刑事诉讼程序中的重要环节，对于保障犯罪嫌疑人的合法权益、维护诉讼程序的公正性和效率性具有重要意义。如果您对此类问题有进一步的疑问或需要更详细的法律解答，请直接向我咨询。