首套房子还清后，二套房一般不可以直接申请变更为首套房。下面我从几个方面来详细解释这个问题：

1. 贷款政策角度：

   • 在大多数地区的银行贷款政策中，首套房和二套房的贷款条件、利率和首付比例都是有所区别的。首套房通常能享受更低的首付比例和更优惠的贷款利率。
   • 一旦你购买了第二套房，并按照二套房的贷款政策申请了贷款，即使你首套房的贷款已经还清，第二套房的贷款记录仍然存在于你的信用记录中，因此无法直接将其变更为首套房。

2. 房产登记角度：

   • 房产登记部门会根据你购房的先后顺序和贷款记录来登记房产信息。首套房和二套房的登记信息是有区别的。
   • 即使你首套房的贷款已经还清，房产登记部门也不会因为你的还款行为而更改房产的登记信息，即将二套房登记为首套房。

3. 税务政策角度：

   • 在一些地区，购买首套房和二套房所享受的税收政策也是不同的。例如，首套房可能享受契税减免等优惠政策。
   • 如果你已经购买了第二套房，并按照二套房的税务政策缴纳了税费，那么即使你首套房的贷款已经还清，你也不能直接申请将二套房的税务待遇变更为首套房的税务待遇。

综上所述，从贷款政策、房产登记和税务政策等多个角度来看，首套房子还清后，二套房一般不可以直接申请变更为首套房。如果你在这方面有具体的法律疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。