入职时，公司通常会要求您提供身份证进行一些必要的核验和登记，但绝不会扣押或长时间保留您的身份证原件。下面我会详细解释公司可能会使用您身份证的几种情况以及相关的注意事项。

首先，公司需要验证您的身份信息，以确保您是合法的劳动者，并且符合招聘条件。这通常包括核对您的姓名、年龄、籍贯等基本信息，以及确认身份证的真伪。这是公司招聘流程中的一个标准环节，旨在保障公司的合法权益，同时也符合相关法律法规的要求。

其次，公司可能会使用您的身份证信息来办理一些入职手续，比如办理社保、公积金、工资卡等。这些都需要您的身份证信息进行身份验证和账户开设。然而，在这些过程中，公司只需要您提供身份证的复印件或影印件，并会在复印件上注明具体用途，以确保您的个人信息安全。

需要注意的是，根据《劳动合同法》第九条的规定，用人单位招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，也不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。因此，如果公司在入职时要求您交出身份证原件进行长时间保留或扣押，这是不合法的行为，您有权拒绝。

为了保护您的个人信息安全，建议您在入职时只提供身份证的复印件或影印件，并在复印件上注明“仅供XXX公司入职使用”等字样，以限制其使用范围。同时，您也要妥善保管好自己的身份证原件，避免将其交给他人或长时间放置在不安全的地方。

总之，入职时公司会使用您的身份证进行一些必要的核验和登记，但绝不会扣押或长时间保留您的身份证原件。如果您遇到公司要求扣押身份证的情况，请务必保持警惕并及时咨询相关部门或法律机构以维护自己的合法权益。