购买40年产权的商业公寓，在多数情况下是不能提取住房公积金的。这主要基于以下几点原因：

1. 政策规定：

   • 根据《住房公积金管理条例》及多数城市的住房公积金管理政策，公积金的提取主要用于购买、建造、翻建、大修自住住房。
   • 40年产权的公寓通常被视为商业性质的房产，不属于自住住房范畴，因此按照这些政策规定是不能提取住房公积金的。

2. 公积金的定向用途：

   • 住房公积金的设计初衷是为了帮助职工解决住房问题，特别是自住住房问题。
   • 商业公寓，尤其是40年产权的，其土地性质为商业性质，与住房公积金的定向用途不符。

3. 特殊情况：

   • 尽管有上述一般规定，但在某些特殊情况下，如果当地住房公积金管理中心有特别规定，或者公寓的实际用途符合自住住房的标准，并且被当地公积金管理中心纳入可提取公积金的住房范围，那么可能有机会提取公积金。
   • 然而，这种情况相对较少，且具体政策可能因地区而异。

4. 操作建议：

   • 鉴于各地政策存在差异，且可能随时调整，建议购房者在考虑提取住房公积金用于购买40年产权公寓前，务必查阅当地的住房公积金管理政策。
   • 最直接且准确的方式是咨询当地的住房公积金管理中心，他们将根据购房者的具体情况和当地政策，给出最准确、最权威的答复。

综上所述，购买40年产权的商业公寓在多数情况下是不能提取住房公积金的。购房者应充分了解相关政策规定，并咨询当地住房公积金管理中心以获取最准确的指导。