农村宅基地面积的计算是一个涉及多个因素的问题，特别是关于二楼面积是否计入宅基地总面积，这需要根据当地的法律法规、政策以及实际情况来确定。以下是对这一问题的详细解答：

一、宅基地二层通常算面积

在一般情况下，宅基地二层的建筑面积是会被计入宅基地的总面积的。这是因为二层作为建筑物的一部分，是在宅基地上合法建设的，其使用的土地空间自然属于宅基地的范畴。在进行宅基地相关的规划、审批以及产权登记等工作中，二层的面积通常都会被纳入考量范围。

二、宅基地确权时的面积计算

然而，在农村宅基地确权的过程中，主要关注的是土地使用权的确认。确权时，通常按照宅基地的地面面积（即一楼占地面积）来计算。这是因为确权的核心是确定土地使用权，而非房屋的所有权。但需要注意的是，如果二楼在建设时已经过合法的宅基地审批手续，并明确包含了二层建设的相关许可内容，其面积在计算时也可能会考虑进去。

对于二楼面积的计算，如果经过合法审批，通常会测量二楼建筑物外墙所围成的水平投影面积，包括阳台等附属部分（按相关规定计算）。这种情况下，二楼面积会作为权益问题处理（如拆迁补偿）的一个参考因素。

三、地区差异与政策影响

值得注意的是，不同地区对于农村宅基地二楼面积的计算和处理规定可能存在差异。有的地方可能更加严格，对未经审批的二楼一律不予确权或计入宅基地面积；而有的地方则可能更为灵活，允许在一定条件下补办手续并确权或计入面积。

四、实际操作建议

1. 在进行农村宅基地面积计算或确权时，建议首先咨询当地的土地管理部门或专业律师，以了解具体的政策和法规。
2. 对于二楼的建筑，应尽可能确保其合法性，以避免未来可能出现的权益纠纷。如果二楼未经审批，应尽快咨询相关部门了解补办审批手续的具体流程和要求。

综上所述，农村宅基地面积的控制和二楼面积的计算是一个复杂的问题，需要根据当地的法律法规、政策以及实际情况来确定。在实际操作中，应综合考虑各方面因素，并遵循当地的具体政策和法规。